Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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