Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms