Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NubplQ9CWD8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms