Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl3Q9CUS9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms