Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms