Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox16Q9CR63 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms