Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc43Q9CR29 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc43Q9CR29 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms