Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms