Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms