Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms