Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem2Q99NH8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem2Q99NH8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms