Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4dQ99N05 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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