Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf17Q99MV7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms