Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms