Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms