Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms