Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TriobpQ99KW3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms