Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms