Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krcc1Q99JT5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krcc1Q99JT5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms