Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8b1Q925Q3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms