Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfdQ925I7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfdQ925I7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfdQ925I7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfdQ925I7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfdQ925I7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms