Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf3Q920N1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Odf3Q920N1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms