Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.4 ms