Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csde1Q91W50 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms