Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms