Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms