Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mark1Q8VHJ5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mark1Q8VHJ5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms