Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms