Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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