Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubxn4Q8VCH8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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