Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim29Q8R2Q0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms