Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sf3b4Q8QZY9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sf3b4Q8QZY9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sf3b4Q8QZY9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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