Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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