Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms