Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms