Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms