Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms