Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms