Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms