Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FgbQ8K0E8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FgbQ8K0E8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FgbQ8K0E8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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FgbQ8K0E8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FgbQ8K0E8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FgbQ8K0E8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FgbQ8K0E8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FgbQ8K0E8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms