Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LgsnQ8CIX8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms