Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Card11Q8CIS0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Card11Q8CIS0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Card11Q8CIS0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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