Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trpm6Q8CIR4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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