Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps50Q8CI71 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps50Q8CI71 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms