Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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