Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RybpQ8CCI5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RybpQ8CCI5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms