Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms