Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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