Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek11Q8C0Q4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nek11Q8C0Q4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nek11Q8C0Q4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nek11Q8C0Q4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nek11Q8C0Q4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek11Q8C0Q4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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