Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx16Q8C080 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms